En Heroes Rise: Prison Break - Parte 2, tu personaje está en una tierra extraña donde todos los héroes han sido derrotados y puestos en la cárcel. Los malos ahora están a cargo. Curiosamente, como te encuentras en esta tierra, te das cuenta de que no estás en tu propio cuerpo, sino que estás viviendo en el cuerpo de un traidor. Este traidor es odiado porque traicionó a los héroes que están en la cárcel y es por eso que los pusieron en la cárcel. Entonces, ahora de alguna manera tienes que justificar tu existencia y descubrir cómo sacar a todos de la cárcel.